Classes and Subpackages of htsjdk.samtools

Subpackages of htsjdk.samtools

htsjdk.samtools.fastq
htsjdk.samtools.filter
htsjdk.samtools.liftover
htsjdk.samtools.metrics
htsjdk.samtools.reference
htsjdk.samtools.samfileheader
htsjdk.samtools.sampairutil
htsjdk.samtools.seekablestream
htsjdk.samtools.util

All Classes in htsjdk.samtools

htsjdk.samtools.AlignmentBlock
htsjdk.samtools.BAMIndex
htsjdk.samtools.BAMRecordCodec
htsjdk.samtools.Bin
htsjdk.samtools.Cigar
htsjdk.samtools.CigarElement
htsjdk.samtools.CigarOperator
htsjdk.samtools.GATKBAMFileSpan
htsjdk.samtools.GATKBAMFileSpanUnitTest
htsjdk.samtools.GATKBin
htsjdk.samtools.GATKChunk
htsjdk.samtools.GATKChunkUnitTest
htsjdk.samtools.LinearIndex
htsjdk.samtools.MergingSamRecordIterator
htsjdk.samtools.PicardNamespaceUtils
htsjdk.samtools.SAMException
htsjdk.samtools.SAMFileHeader
htsjdk.samtools.SAMFileReader
htsjdk.samtools.SAMFileSpan
htsjdk.samtools.SAMFileWriter
htsjdk.samtools.SAMFileWriterFactory
htsjdk.samtools.SAMFileWriterImpl
htsjdk.samtools.SAMProgramRecord
htsjdk.samtools.SAMReadGroupRecord
htsjdk.samtools.SAMRecord
htsjdk.samtools.SAMRecordCoordinateComparator
htsjdk.samtools.SAMRecordIterator
htsjdk.samtools.SAMRecordQueryNameComparator
htsjdk.samtools.SAMRecordSetBuilder
htsjdk.samtools.SAMSequenceDictionary
htsjdk.samtools.SAMSequenceRecord
htsjdk.samtools.SAMTextHeaderCodec
htsjdk.samtools.SAMTextWriter
htsjdk.samtools.SAMValidationError
htsjdk.samtools.SamFileHeaderMerger
htsjdk.samtools.SamFileValidator
htsjdk.samtools.SamReader
htsjdk.samtools.SecondaryOrSupplementarySkippingIterator
htsjdk.samtools.TextCigarCodec
htsjdk.samtools.ValidationStringency

All source code are property of their respective owners. Java is a trademark of Sun Microsystems, Inc and owned by ORACLE Inc. Contact coftware#gmail.com.